MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 56183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
2	NC_017333	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
3	NC_017333	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601292
4	NC_017333	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601292
5	NC_017333	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
6	NC_017333	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601292
7	NC_017333	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
8	NC_017333	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
9	NC_017333	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	387601292
10	NC_017333	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
11	NC_017333	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	387601292
12	NC_017333	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601292
13	NC_017333	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601292
14	NC_017333	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
15	NC_017333	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
16	NC_017333	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601292
17	NC_017333	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
18	NC_017333	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
19	NC_017333	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
20	NC_017333	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601292
21	NC_017333	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
22	NC_017333	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
23	NC_017333	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
24	NC_017333	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
25	NC_017333	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	387601292
26	NC_017333	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387601292
27	NC_017333	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
28	NC_017333	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601292
29	NC_017333	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	387601292
30	NC_017333	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	387601292
31	NC_017333	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	387601292
32	NC_017333	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
33	NC_017333	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601292
34	NC_017333	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	387601292
35	NC_017333	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	387601292
36	NC_017333	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
37	NC_017333	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
38	NC_017333	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	387601293
39	NC_017333	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
40	NC_017333	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
41	NC_017333	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601293
42	NC_017333	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
43	NC_017333	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601293
44	NC_017333	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	387601293
45	NC_017333	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	387601293
46	NC_017333	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	387601293
47	NC_017333	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
48	NC_017333	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	387601293
49	NC_017333	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	387601293
50	NC_017333	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
51	NC_017333	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601293
52	NC_017333	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	387601293
53	NC_017333	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
54	NC_017333	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
55	NC_017333	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	387601293
56	NC_017333	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
57	NC_017333	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601293
58	NC_017333	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	387601293
59	NC_017333	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
60	NC_017333	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601293
61	NC_017333	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
62	NC_017333	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
63	NC_017333	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601293
64	NC_017333	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
65	NC_017333	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
66	NC_017333	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601293
67	NC_017333	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	387601293
68	NC_017333	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	387601293
69	NC_017333	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	387601293
70	NC_017333	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
71	NC_017333	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
72	NC_017333	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
73	NC_017333	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601293
74	NC_017333	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	387601293
75	NC_017333	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601294
76	NC_017333	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601294
77	NC_017333	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601294
78	NC_017333	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601294
79	NC_017333	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	387601294
80	NC_017333	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	387601294
81	NC_017333	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	387601294
82	NC_017333	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
83	NC_017333	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	387601295
84	NC_017333	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601295
85	NC_017333	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	387601295
86	NC_017333	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601295
87	NC_017333	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387601295
88	NC_017333	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601295
89	NC_017333	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601295
90	NC_017333	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601295
91	NC_017333	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	387601295
92	NC_017333	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601295
93	NC_017333	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
94	NC_017333	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601295
95	NC_017333	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601295
96	NC_017333	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
97	NC_017333	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
98	NC_017333	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
99	NC_017333	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
100	NC_017333	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601296
101	NC_017333	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	387601296
102	NC_017333	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	387601296
103	NC_017333	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601296
104	NC_017333	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	387601296
105	NC_017333	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601296
106	NC_017333	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	387601296
107	NC_017333	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
108	NC_017333	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387601296
109	NC_017333	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
110	NC_017333	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
111	NC_017333	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	387601296
112	NC_017333	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
113	NC_017333	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	387601296
114	NC_017333	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
115	NC_017333	ACA	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601296
116	NC_017333	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	387601296
117	NC_017333	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
118	NC_017333	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
119	NC_017333	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
120	NC_017333	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
121	NC_017333	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
122	NC_017333	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
123	NC_017333	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
124	NC_017333	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	387601296
125	NC_017333	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
126	NC_017333	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
127	NC_017333	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387601296
128	NC_017333	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
129	NC_017333	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	387601296
130	NC_017333	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
131	NC_017333	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
132	NC_017333	CTG	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
133	NC_017333	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	387601296
134	NC_017333	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	387601296
135	NC_017333	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	387601296
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139	NC_017333	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	387601296
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159	NC_017333	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601297
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252	NC_017333	CGTTG	2	10	11732	11741	0 %	40 %	40 %	20 %	387601299
253	NC_017333	AATG	2	8	11808	11815	50 %	25 %	25 %	0 %	387601299
254	NC_017333	GGT	2	6	11872	11877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601299
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259	NC_017333	AAG	2	6	12137	12142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601299
260	NC_017333	GCT	2	6	12166	12171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601299
261	NC_017333	ATT	2	6	12187	12192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601299
262	NC_017333	GT	3	6	12206	12211	0 %	50 %	50 %	0 %	387601299
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264	NC_017333	ATG	2	6	12293	12298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601299
265	NC_017333	CCAT	2	8	12316	12323	25 %	25 %	0 %	50 %	387601299
266	NC_017333	CAAT	2	8	12379	12386	50 %	25 %	0 %	25 %	387601299
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384	NC_017333	A	6	6	19011	19016	100 %	0 %	0 %	0 %	387601305
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